Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q8VDP2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q8VDP2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q8VDP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms