Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alg12Q8VDB2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alg12Q8VDB2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms