Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hip1Q8VD75 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1Q8VD75 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms