Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCN5

Cth, Cystathionine gamma-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CthQ8VCN5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CthQ8VCN5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CthQ8VCN5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms