Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubg2Q8VCK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms