Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms