Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms