Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg10Q8R1P4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms