Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms