Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms