Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3X6

Anks4b, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks4bQ8K3X6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks4bQ8K3X6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks4bQ8K3X6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks4bQ8K3X6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks4bQ8K3X6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms