Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casc3Q8K3W3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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