Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms