Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssh3Q8K330 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms