Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms