Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms