Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1bQ8JZL7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rasgef1bQ8JZL7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rasgef1bQ8JZL7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rasgef1bQ8JZL7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rasgef1bQ8JZL7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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