Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ago3Q8CJF9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ago3Q8CJF9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms