Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip10Q8CJ53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms