Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CopaQ8CIE6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms