Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab11fip3Q8CHD8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip3Q8CHD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms