Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms