Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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