Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc9Q8CDN9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms