Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm1bQ8CC62 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm1bQ8CC62 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm1bQ8CC62 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm1bQ8CC62 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm1bQ8CC62 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms