Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms