Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Atg4aQ8C9S8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg4aQ8C9S8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Atg4aQ8C9S8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg4aQ8C9S8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg4aQ8C9S8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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