Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4X7

UPF0258 protein KIAA1024-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C4X7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8C4X7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms