Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q8C1R3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C1R3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms