Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlrc2Q8BZW8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms