Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Iffo1Q8BXL9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms