Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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