Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms