Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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