Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms