Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsampQ8BLK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms