Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Tmem87bQ8BKU8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem87bQ8BKU8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem87bQ8BKU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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