Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy1Q8BIJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms