Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdca8Q8BHX3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms