Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms