Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms