Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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