Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms