Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nmes1Q810Q5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmes1Q810Q5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms