Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc27Q80YS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrrc27Q80YS5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrrc27Q80YS5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrrc27Q80YS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrrc27Q80YS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc27Q80YS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms