Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttc28Q80XJ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms