Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrde2Q80XC6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrde2Q80XC6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms