Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc155Q80VJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms