Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sestd1Q80UK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sestd1Q80UK0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms