Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms